学歴

  • 1999年3月31日 東京大学工学部 計数工学科 卒業
  • 2005年3月31日 東京医科歯科大学大学院 医歯学総合研究科 先端医療開発学系 遺伝子・分子医学 生命情報学(博士課程) 修了 博士(医学)取得


職歴

  • 2005年4月1日-2006年3月31日 日本医療情報ネットワーク協会 主任研究員
  • 2006年4月1日-2006年12月31日 東京医科歯科大学情報医科学センター 特任助手
  • 2007年1月1日-2007年3月31日 東京医科歯科大学 難治疾患研究所 ゲノム応用医学研究部門 生命情報学 助手
  • 2007年4月1日-2012年4月30日 東京医科歯科大学 難治疾患研究所 ゲノム応用医学研究部門 生命情報学  助教
  • 2012年5月1日- 東北大学 東北メディカル・メガバンク機構 医療情報ICT部門 バイオクリニカル分野 講師


研究助成金

  • 文部科学研究費補助金 基盤研究(A)「階層的オミックス医療情報のデータ交換形式と多軸的・多面的なオントロジーの整備」研究分担者(2014年度-2016年度)
  • 厚生労働科学研究費補助金 難治性疾患等克服研究事業「患者団体等が主体的に運用する疾患横断的な患者レジストリのデータの収集・分析による難病患者のQOL向上及び政策支援のための基礎的知見の収集」研究代表者(2014年度)
  • 文部科学研究費補助金 基盤研究(C)「遺伝子-遺伝子発現-環境相互作用によるポテンシャルにおける癌アトラクターの解析」研究代表者(2013年度-2015年度)
  • 文部科学研究費補助金 基盤研究(C)「長寿遺伝子による骨代謝制御機構の解明」研究分担者(2012年度-2014年度)
  • 厚生労働科学研究費補助金 難治性疾患等克服研究事業「患者支援団体等が主体的に難病研究支援を実施するための体制構築に向けた研究」研究分担者(2012年度-2013年度)
  • 文部科学研究費補助金 若手研究(B)「発生・分化システムの時系列遺伝子発現の安定状態 (アトラクター)の同定と遷移解析」研究代表者(2010年度-2012 年度)
  • 文部科学研究費補助金 若手研究(B)「初期胚発生の Hox を中心とした転写調節ネットワー クのシステム進化解析」研究代表者(2008年度-2009年度)
  • 文部科学研究費補助金  特定領域研究「ゲノム」4 領域「選択的スプライシングを受ける遺伝子 の探索とシス・エレメントの体系的解析」研究分担者(2008年度)


学会活動

  • International Society for Computational Biology (ISCB) member
  • American Medical Informatics Association (AMIA) member
  • 日本バイオインフォマティクス学会 会員
  • 情報計算化学生物学会 会員
  • 日本オミックス医療学会 会員
  • 日本医療情報学会 会員
  • 2011年4月1日-2013年10月31日 オミックス医療研究会 監事
  • 2013年11月1日- オミックス医療学会 幹事
  • 2010年10月1日-2012年5月31日 日本バイオインフォマティクス学会 応用システムバイオロジー研究会 副査
  • 2012年6月1日- 日本バイオインフォマティクス学会 生命システム理論研究会 副査
  • 2014年4月1日- 日本バイオインフォマティクス学会 理事
  • 2013年6月27日- 情報計算化学生物学会 CBIジャーナル 編集委員 第3分野長
  • 2014年4月1日- 情報計算化学生物学会 評議員


学術集会・研究会活動

  • 生命医薬情報学連合大会 2012年・2014年大会 実行委員
  • 情報計算化学生物学会 2013年・2014年大会 プログラム委員
  • 次世代シーケンス現場の会 第2回・第4回研究会 実行委員
  • オープンバイオ研究会 スタッフ
  • Linked Open Data チャレンジ Japan 2011 実行委員


受賞

  • Asia Pacific Bioinformatics Conference 2011 the Best Poster Awards
  • Oxford Journals – Japanese Society for Bioinformatics Prize 2012


教育活動

  • 東京医科歯科大学大学院医歯学総合研究科 / 大学院疾患生命科学研究部・大学院生命情報科学教育部 「生命情報学特論・生命システム情報学特論」2007 年-2011 年 東京医科歯科大学
  • 東京医科歯科大学大学院医歯学総合研究科「バイオインフォマティクス」2012年- 東京医科歯科大学
  • 東京医科歯科大学大学院疾患生命科学研究部・大学院生命情報科学教育部 「疾患オミックス情報学特論」2011年 東京医科歯科大学
  • 東京医科歯科大学大学院医歯学総合研究科「疾患オミックス情報学特論」2012年- 東京医科歯科大学
  • 東京医科歯科大学 大学院 疾患生命科学研究部・生命情報科学教育部 “Computational Systems Biology” 2009 年, 2011 年 東京医科歯科大学
  • 東京医科歯科大学がん治療高度専門家養成プログラム「がんのシステム生物学概論」2012年- 東京医科歯科大学
  • 東京医科歯科大学大学院医歯学総合研究科 / 大学院疾患生命科学研究部・大学院生命情報科学教育部 「コンピュータプログラミング実習」2007 年-2011 年 東京医科歯科大学
  • 科学技術振興調整費 新興分野人材養成 バイオ医療オミックス情報学 人材養成 プログラム「生命情報学・システム生物学」2006 年-2009 年 東京医科歯科大学
  • 東京医科歯科大学 歯学部「基礎情報医歯学」2006 年-2011 年 東京医科歯科大学
  • 東京医科歯科大学 医学部保健衛生学科 検査技術学専攻「医学情報処理演習 II」 2007 年-2011 年 東京医科歯科大学.
  • 国立遺伝学研究所 JST BIRD 受託事業「バイオ情報資源の高準化と共有化」WABI ワークショップ 2009年11月26日-27日 ライフサイエンス統合データベースセンター
  • 科学技術振興調整費 新興分野人材養成 生命情報科学技術者養成コース バイオ インフォマティクス速習コース「遺伝子発現データ解析」2006年11月9日 産業総合研究所 生命情報科学研究センター
  • 岡山大学現代 GP バイオインフォマティクス講座「バイオインフォマティクス基礎講義 – ゲノム配列解析とマイクロアレイ解析の基礎」2006年6月7日-8日 岡山大学
  • 神奈川科学技術アカデミー教育講座 バイオインフォマティクスコース「KNOBで利用できる代表的な解析ソフトウェアの活用実習」2005年11月30日 東京大学医科学研究所
  • 経産省バイオ人材育成事業 アノテーター育成実証講座「遺伝子発現プロファイル解析」2004年11月10日, 17日, 24日 マホレックス
  • 経産省バイオ人材育成事業セミナー「プロテオーム解析/パスウェイ解析」 2003年11月7日社団法人バイオ産業情報化コンソーシアム


社会活動

  • ジェイレア・ネット(J-RARE.net) 運営委員・運営事務局